29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5783 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 457 aa  958    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  42.58 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.78 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.8 
 
 		 378 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  31.02 
 
 		 815 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  30.92 
 
 		 586 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.21 
 
 		 1034 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.21 
 
 		 1034 aa  87  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.72 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.17 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  25.18 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.42 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.75 
 
 		 1074 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.5 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.77 
 
 		 889 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.71 
 
 		 632 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  25.18 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.81 
 
 		 1061 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.44 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.28 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  23.84 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  25.57 
 
 		 507 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.04 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.15 
 
 		 824 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  23.62 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>