62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4082 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 626 aa  1277    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  90.46 
 
 		 628 aa  1118    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.91 
 
 		 632 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  64.81 
 
 		 606 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  66.07 
 
 		 428 aa  525  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.71 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  52.59 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  67.82 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  62.43 
 
 		 518 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  61.24 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.25 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.82 
 
 		 1034 aa  165  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  52.78 
 
 		 717 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.83 
 
 		 1034 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  49.48 
 
 		 802 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 773 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.92 
 
 		 1074 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.29 
 
 		 1061 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.21 
 
 		 432 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.42 
 
 		 440 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.76 
 
 		 889 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.13 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.99 
 
 		 824 aa  117  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.17 
 
 		 356 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  30 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  27.83 
 
 		 429 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  29.59 
 
 		 507 aa  91.3  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  26.32 
 
 		 502 aa  88.2  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.78 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.36 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.03 
 
 		 821 aa  69.3  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.43 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.43 
 
 		 557 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  28.42 
 
 		 815 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  26.88 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.82 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.42 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.4 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.73 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.09 
 
 		 559 aa  57  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.26 
 
 		 361 aa  54.3  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.89 
 
 		 558 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 		 262 aa  53.9  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  23.11 
 
 		 356 aa  53.9  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.5 
 
 		 375 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.13 
 
 		 374 aa  50.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.35 
 
 		 376 aa  48.5  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.24 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.28 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.93 
 
 		 378 aa  45.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.12 
 
 		 375 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.95 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  24.17 
 
 		 375 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.48 
 
 		 432 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.17 
 
 		 563 aa  43.9  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.48 
 
 		 497 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.37 
 
 		 386 aa  43.9  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.93 
 
 		 375 aa  43.5  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>