33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4108 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
557 aa  1159    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.68 
 
 
557 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.92 
 
 
553 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.61 
 
 
563 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.53 
 
 
561 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.79 
 
 
568 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.43 
 
 
558 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.95 
 
 
559 aa  339  7e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.08 
 
 
563 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.27 
 
 
619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.73 
 
 
573 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.03 
 
 
626 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  38.05 
 
 
403 aa  77  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.56 
 
 
628 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.21 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 
632 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  33.33 
 
 
606 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.93 
 
 
1034 aa  67  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.93 
 
 
1034 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.22 
 
 
428 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.31 
 
 
446 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.31 
 
 
432 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.84 
 
 
440 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  27.03 
 
 
821 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.26 
 
 
1061 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.91 
 
 
824 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  24.32 
 
 
586 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.03 
 
 
773 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.1 
 
 
379 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.68 
 
 
889 aa  47.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.31 
 
 
375 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.89 
 
 
406 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  35.48 
 
 
815 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>