63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1581 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
559 aa  1140    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.92 
 
 
557 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.96 
 
 
563 aa  527  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.41 
 
 
553 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.19 
 
 
568 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.01 
 
 
558 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.94 
 
 
561 aa  455  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.95 
 
 
557 aa  339  7e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.52 
 
 
563 aa  316  8e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.15 
 
 
573 aa  301  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.34 
 
 
619 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.17 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  34.23 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
889 aa  67.4  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.56 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.43 
 
 
632 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  26.17 
 
 
821 aa  58.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.96 
 
 
628 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.09 
 
 
626 aa  57.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.23 
 
 
824 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  28.7 
 
 
606 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.77 
 
 
1061 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.63 
 
 
383 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.81 
 
 
432 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.22 
 
 
422 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  28.07 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.58 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.37 
 
 
1034 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.67 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.8 
 
 
379 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.51 
 
 
375 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.03 
 
 
845 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.19 
 
 
375 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.05 
 
 
606 aa  48.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.58 
 
 
581 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.05 
 
 
606 aa  48.5  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.58 
 
 
581 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.43 
 
 
440 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.63 
 
 
1034 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.92 
 
 
911 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  26.67 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.19 
 
 
375 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.7 
 
 
581 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.98 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.38 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.81 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.77 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  26.97 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.28 
 
 
378 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.37 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  29.36 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.63 
 
 
609 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.97 
 
 
382 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.06 
 
 
860 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.7 
 
 
375 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.07 
 
 
380 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
376 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.31 
 
 
1074 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  31.52 
 
 
382 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.44 
 
 
850 aa  43.9  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.52 
 
 
382 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  31.87 
 
 
425 aa  43.9  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  27.83 
 
 
400 aa  43.5  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>