58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6479 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  61.67 
 
 
628 aa  733    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  63.75 
 
 
626 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  59.65 
 
 
632 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1245    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  69 
 
 
428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.92 
 
 
439 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  52.8 
 
 
403 aa  362  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  95.4 
 
 
502 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  66.12 
 
 
518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  66.67 
 
 
519 aa  213  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  55.11 
 
 
717 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  52.85 
 
 
802 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 
378 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.12 
 
 
1061 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.13 
 
 
1034 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.25 
 
 
773 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.13 
 
 
1034 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.82 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.71 
 
 
1074 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  27.86 
 
 
586 aa  123  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.5 
 
 
440 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.86 
 
 
824 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.76 
 
 
432 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  31.03 
 
 
507 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  26.83 
 
 
429 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.03 
 
 
889 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.99 
 
 
356 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.18 
 
 
457 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  23.08 
 
 
821 aa  75.1  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  24.4 
 
 
502 aa  73.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
557 aa  70.1  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.54 
 
 
563 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  27.78 
 
 
815 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.73 
 
 
557 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.12 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.13 
 
 
568 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.7 
 
 
559 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.9 
 
 
414 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.9 
 
 
414 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.9 
 
 
414 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.41 
 
 
561 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.57 
 
 
553 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.35 
 
 
558 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  25.55 
 
 
423 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.66 
 
 
375 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.45 
 
 
262 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.95 
 
 
375 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.35 
 
 
374 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  21.92 
 
 
356 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.53 
 
 
375 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.82 
 
 
375 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.24 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.59 
 
 
563 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
583 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  24.82 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.24 
 
 
375 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.11 
 
 
376 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0345  proprotein convertase P  25.13 
 
 
693 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>