88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2324 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  96.8 
 
 		 375 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  100 
 
 		 375 aa  775    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.15 
 
 		 375 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  66.31 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  63.56 
 
 		 382 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  63.3 
 
 		 382 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  63.3 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  63.03 
 
 		 382 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  61.7 
 
 		 378 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.09 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  50.79 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.74 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.28 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  48 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.4 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.07 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.01 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.48 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.81 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  49.07 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  46.93 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  48.14 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.54 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  46.81 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.54 
 
 		 375 aa  362  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.01 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.74 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.39 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.87 
 
 		 376 aa  360  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.32 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.87 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  45.6 
 
 		 374 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.38 
 
 		 381 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.11 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.13 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.48 
 
 		 380 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  47.17 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.04 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  45.09 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  45.09 
 
 		 384 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  45.09 
 
 		 384 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  45.09 
 
 		 384 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  45.09 
 
 		 384 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  43.2 
 
 		 384 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  44.83 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  44.83 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.67 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.99 
 
 		 379 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.29 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.01 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.29 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.29 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.86 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.86 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  44.93 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.01 
 
 		 384 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.61 
 
 		 369 aa  308  9e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.56 
 
 		 384 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.29 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.89 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  35.96 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  27.22 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.28 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  24.39 
 
 		 463 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.44 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  26.67 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.26 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.73 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.67 
 
 		 497 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.67 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.21 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.67 
 
 		 599 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  27.63 
 
 		 840 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.78 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.89 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  30.93 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  27.17 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.66 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.09 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.97 
 
 		 628 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  26.36 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.17 
 
 		 626 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.44 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.57 
 
 		 1034 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>