88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2315 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  79.47 
 
 		 375 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  78.67 
 
 		 375 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  78.07 
 
 		 374 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  77.87 
 
 		 375 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  78.13 
 
 		 375 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  79.47 
 
 		 375 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.73 
 
 		 375 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  78.93 
 
 		 375 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  89.07 
 
 		 375 aa  707    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  82.93 
 
 		 375 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  79.47 
 
 		 375 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  79.47 
 
 		 375 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 375 aa  782    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  77.87 
 
 		 375 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  78.4 
 
 		 375 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  76.2 
 
 		 376 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  75.73 
 
 		 375 aa  616  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  71.43 
 
 		 378 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.92 
 
 		 379 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  57.49 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  57.11 
 
 		 380 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  56.42 
 
 		 374 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  56.42 
 
 		 376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  57.07 
 
 		 375 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  52.67 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  54.13 
 
 		 379 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.37 
 
 		 384 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.11 
 
 		 383 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.41 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.2 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.46 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.6 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.27 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.73 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.92 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  49.08 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.66 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  46.01 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.4 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  45.74 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  48.41 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  48.41 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.54 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  48.68 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  48.41 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  48.68 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  48.68 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  48.41 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.49 
 
 		 388 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  48.65 
 
 		 381 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.18 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.18 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.18 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.9 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.63 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.18 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.63 
 
 		 384 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.01 
 
 		 382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  46.28 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  48.62 
 
 		 384 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.28 
 
 		 382 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.68 
 
 		 378 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.23 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.62 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  41.81 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.96 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  27.5 
 
 		 463 aa  92.8  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  26.01 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  27.18 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.97 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.58 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  33.06 
 
 		 490 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.19 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.46 
 
 		 557 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.05 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.22 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.46 
 
 		 439 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  26.95 
 
 		 606 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.37 
 
 		 628 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.52 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  29.66 
 
 		 840 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.57 
 
 		 609 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.79 
 
 		 626 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.15 
 
 		 631 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.52 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.03 
 
 		 821 aa  43.5  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.57 
 
 		 559 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>