113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4236 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 497 aa  1025    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  52.24 
 
 		 490 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  45.37 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  41.16 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.86 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  38.1 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  32.26 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.71 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.38 
 
 		 606 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.38 
 
 		 606 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.41 
 
 		 375 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.29 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.21 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.25 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.85 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.17 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.11 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.49 
 
 		 599 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.1 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.6 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  29.85 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.86 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  31.25 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.06 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.03 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.83 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  30.36 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.73 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.07 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.58 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.28 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.95 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.9 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.34 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  29.66 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.34 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  26.9 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  26.9 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.58 
 
 		 379 aa  57  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  27.94 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  27.94 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.45 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.6 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.65 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  27.94 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  27.94 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  27.94 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  27.94 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  27.94 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.66 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 		 541 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  28.67 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.78 
 
 		 557 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.51 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  27.13 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  29.84 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.6 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.66 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.51 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.5 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  27.21 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.94 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.5 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.94 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.94 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.07 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.66 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  28.99 
 
 		 384 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  32.04 
 
 		 840 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  32.08 
 
 		 821 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.99 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  31.15 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.21 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.04 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.24 
 
 		 612 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  38.55 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  29.5 
 
 		 459 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.9 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.58 
 
 		 559 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.13 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  32.38 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.9 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.43 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  28.67 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.53 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.65 
 
 		 631 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.09 
 
 		 379 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.69 
 
 		 581 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.69 
 
 		 581 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.69 
 
 		 581 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.72 
 
 		 432 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>