More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8267 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  46.12 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  46.5 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.83 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.57 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 241 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  34.48 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  30.67 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.93 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  25.25 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.05 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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