130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0589 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0589  porin  100 
 
 		 344 aa  689    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  76.14 
 
 		 348 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  72.65 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  69.57 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  71.68 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  69.6 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  68.56 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  67.6 
 
 		 353 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  66.57 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  66.57 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  65.04 
 
 		 365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  64.78 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  66.02 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  63.86 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  63.91 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  64.17 
 
 		 353 aa  427  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  56.66 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  58.43 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  56.34 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  56.58 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  54.93 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  55.21 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  56.15 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  56.15 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  56.15 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  56.62 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  54.78 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  53.14 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  51.4 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  51.4 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  47.87 
 
 		 338 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  37.22 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  38.62 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  37.08 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  36.23 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  36.2 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  32.44 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  31.06 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  30.34 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  28.48 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  30.03 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  30.03 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  30.59 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  30.09 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  30.28 
 
 		 313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  28.57 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  28.48 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  29.97 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  29.97 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  28.48 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  27.25 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  26.4 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  27.33 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  26.01 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.48 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  25.39 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  28.39 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  27.04 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  28.97 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  26.91 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  25.4 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  24.44 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  26.6 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  28.29 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  22.7 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.85 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1642  porin  30.89 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000869717  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  22.61 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  23.32 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  29.34 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  31.3 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  25.39 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  25.39 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  25.39 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  25.08 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  34.11 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  29.94 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000050808  unclonable  0.0000817359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  30.77 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  23.87 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  30.77 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.77 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  29.93 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  26.52 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  28.4 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  24.78 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  24.7 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  30.41 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  23.77 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  25.32 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  24.44 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  24.66 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  25.32 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1463  porin  32.59 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000881778  normal  0.0418658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  22.42 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0935  OmpC family outer membrane porin  28.76 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000655737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  24.86 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  25.32 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  22.77 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  38.98 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  27.61 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>