More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0935 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0935  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 372 aa  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000655737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  47.18 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  34.17 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  32.17 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  32.17 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  33.05 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  31.9 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  31.69 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  28.79 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  40.53 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  38.24 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  29.89 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  38.83 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  29.58 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  29.46 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  28.01 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  27.56 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  37.89 
 
 		 405 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.5 
 
 		 389 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  37.82 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  29.16 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  36.76 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  36.76 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  36.76 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.07 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.07 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  36.23 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  29.8 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  38.1 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  29.37 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  36.92 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  37.77 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  30.19 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  30.19 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  30.19 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  31.37 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  29.91 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  28.65 
 
 		 351 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  37.5 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  35.57 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  27.71 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  35.18 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  34.47 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  31.43 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  29.17 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  35.98 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  35 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  28.21 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  27.83 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  27.32 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  28.86 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  35 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  31.7 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  29.23 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  27.18 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  31.09 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  31.09 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  35.57 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  31.7 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  36.32 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  28.19 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  28.98 
 
 		 402 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  29.19 
 
 		 368 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  29.08 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  34.15 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  36.22 
 
 		 406 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  30.33 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  25 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  36.55 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  29.53 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  29.17 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  29.17 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.46 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  28.91 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  34.5 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  25.93 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  29.53 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  30.41 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  28.49 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  28.69 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  33.82 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  28.69 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  31.56 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  28.69 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  28.69 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  33.17 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  28.39 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  29.97 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  31.56 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  33.03 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  34.83 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  36.84 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  28.07 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  31.56 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  36.84 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  36.84 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  28.77 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  29.14 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  28.42 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>