More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  62.64 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  57.8 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  50.55 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  55.8 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  55.97 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 219 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  38.17 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  37.43 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  34.03 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 257 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  88.2  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>