148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0789 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0789  porin  100 
 
 
346 aa  686  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.29455e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  85.59 
 
 
354 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.9607e-08  unclonable  3.54557e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  85.59 
 
 
354 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.55579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  82.47 
 
 
365 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.36075e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  85.84 
 
 
353 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.31419e-06  unclonable  2.51685e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  84.83 
 
 
356 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.70281e-08  hitchhiker  4.79229e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  82.73 
 
 
359 aa  582  1e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.51944e-08  decreased coverage  3.18488e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  79.67 
 
 
369 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  73.93 
 
 
348 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  72.52 
 
 
342 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.38522e-07  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  69.38 
 
 
353 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.1464e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  68.19 
 
 
342 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.45606e-07  unclonable  1.65223e-10 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  65.48 
 
 
361 aa  469  1e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.69892e-08  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  68.56 
 
 
344 aa  460  1e-128  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  4.86852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  65.14 
 
 
342 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  65.17 
 
 
347 aa  445  1e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  56.39 
 
 
352 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.45814e-07  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  56.08 
 
 
354 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  54.55 
 
 
347 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  55.25 
 
 
354 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  1.46698e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  54.55 
 
 
372 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  55.25 
 
 
354 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  54.97 
 
 
354 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  56.08 
 
 
354 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.96209e-05  hitchhiker  5.99213e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  55.25 
 
 
354 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.1631e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  53.87 
 
 
354 aa  362  7e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.94692e-05  decreased coverage  3.62774e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  53.04 
 
 
354 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  5.40368e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  52.76 
 
 
354 aa  357  2e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  4.57647e-05  unclonable  2.46582e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  50.96 
 
 
355 aa  353  3e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  52.39 
 
 
351 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  45.78 
 
 
338 aa  278  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2403  outer membrane porin, putative  36.95 
 
 
351 aa  190  3e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.987816  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1973  porin  35.81 
 
 
349 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.321076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  35.1 
 
 
346 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  34.63 
 
 
345 aa  183  5e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2092  porin  35.94 
 
 
346 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.078027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0811  outer membrane porin, putative  35.76 
 
 
342 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.52 
 
 
314 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.45677e-07  hitchhiker  6.46129e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  31.21 
 
 
314 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.6835e-06  hitchhiker  1.68324e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  31.44 
 
 
317 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.91313e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  31.21 
 
 
314 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.03454e-06  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  28.78 
 
 
321 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  30.28 
 
 
308 aa  135  1e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  30.93 
 
 
314 aa  134  2e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  30.03 
 
 
314 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  30.03 
 
 
314 aa  132  7e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  29.73 
 
 
313 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  28.92 
 
 
314 aa  130  4e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  8.71207e-05  hitchhiker  1.30468e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  28.99 
 
 
315 aa  129  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  28.41 
 
 
314 aa  127  2e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  28.53 
 
 
316 aa  128  2e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.7597e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  26.54 
 
 
316 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  27.51 
 
 
340 aa  118  1e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  28.81 
 
 
316 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.9899e-06  unclonable  3.82336e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.89 
 
 
302 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  29.97 
 
 
362 aa  93.6  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  2.07768e-05  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  31.36 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  8.64013e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  27.51 
 
 
345 aa  84.3  3e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  9.37994e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  27.8 
 
 
339 aa  81.3  2e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  6.3685e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  25.4 
 
 
342 aa  76.3  7e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  23.81 
 
 
371 aa  68.6  1e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  24.27 
 
 
366 aa  67.4  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  25.49 
 
 
357 aa  67  4e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  23.92 
 
 
374 aa  64.7  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  24.66 
 
 
349 aa  60.8  3e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1671  porin  28.99 
 
 
363 aa  57  5e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.74529e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  25.66 
 
 
362 aa  55.5  1e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  26.63 
 
 
354 aa  55.5  1e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  2.27625e-07  unclonable  3.18865e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  24.78 
 
 
368 aa  55.1  2e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  1.97819e-07  unclonable  2.88423e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  25.51 
 
 
344 aa  54.7  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  25.29 
 
 
363 aa  53.9  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  25.22 
 
 
344 aa  54.3  3e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  25.29 
 
 
362 aa  53.9  4e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  1.44829e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  25.29 
 
 
362 aa  53.9  4e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  25.29 
 
 
362 aa  53.9  4e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  25.29 
 
 
362 aa  53.9  4e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  25.29 
 
 
362 aa  53.9  4e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  25.29 
 
 
362 aa  53.9  4e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  25.71 
 
 
352 aa  53.5  5e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  27.27 
 
 
311 aa  52.8  1e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  30.46 
 
 
361 aa  52.4  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  23.75 
 
 
368 aa  52  1e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  25 
 
 
338 aa  52.4  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  24.78 
 
 
344 aa  52.4  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  23.75 
 
 
368 aa  52  1e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  28.12 
 
 
370 aa  51.6  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  23.82 
 
 
368 aa  51.6  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  25.85 
 
 
413 aa  50.8  3e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  25.27 
 
 
394 aa  50.8  3e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  23.92 
 
 
360 aa  50.4  4e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  25.55 
 
 
333 aa  50.1  5e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  1.36886e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  27.13 
 
 
358 aa  50.4  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  24.31 
 
 
369 aa  50.1  5e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  27.13 
 
 
358 aa  50.4  5e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  24.31 
 
 
369 aa  50.4  5e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  27.13 
 
 
358 aa  50.4  5e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  25.8 
 
 
358 aa  50.1  6e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1877  porin  27.16 
 
 
361 aa  50.1  6e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  5.0808e-06  unclonable  8.17359e-05 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  30.56 
 
 
376 aa  49.7  7e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  25.8 
 
 
387 aa  49.7  7e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>