More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4327 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  54.43 
 
 		 1013 aa  909    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  73.5 
 
 		 1055 aa  1384    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1029 aa  1993    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  31.26 
 
 		 1034 aa  309  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.27 
 
 		 1067 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30 
 
 		 1126 aa  214  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.04 
 
 		 713 aa  208  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.99 
 
 		 1143 aa  207  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.12 
 
 		 1163 aa  206  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.9 
 
 		 1139 aa  200  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 1193 aa  188  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 1190 aa  179  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 1089 aa  178  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.18 
 
 		 1075 aa  174  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 1015 aa  164  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 		 1022 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  28.83 
 
 		 1083 aa  155  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.71 
 
 		 1109 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 1116 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 1216 aa  145  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 648 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.48 
 
 		 494 aa  141  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.43 
 
 		 1149 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.42 
 
 		 992 aa  132  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.18 
 
 		 967 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 		 1429 aa  127  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 1121 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 1235 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.82 
 
 		 1122 aa  125  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  32.06 
 
 		 1051 aa  124  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.43 
 
 		 1271 aa  124  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.97 
 
 		 1118 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.18 
 
 		 1160 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 954 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.96 
 
 		 1054 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.78 
 
 		 983 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.07 
 
 		 1056 aa  121  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 1403 aa  121  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  31.16 
 
 		 1118 aa  121  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.98 
 
 		 1029 aa  121  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 1118 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 		 647 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.8 
 
 		 1422 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.14 
 
 		 1403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.55 
 
 		 1123 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  28.41 
 
 		 647 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.24 
 
 		 1148 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.98 
 
 		 1291 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 723 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 1064 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 1148 aa  115  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.32 
 
 		 1117 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.64 
 
 		 1132 aa  114  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.2 
 
 		 916 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 1217 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 973 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 		 1138 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.31 
 
 		 1150 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 1141 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 1141 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.03 
 
 		 1141 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 998 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.71 
 
 		 1134 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.28 
 
 		 1774 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.39 
 
 		 900 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 1141 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.58 
 
 		 1227 aa  109  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 1139 aa  108  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  32.28 
 
 		 992 aa  108  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1298 aa  108  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 		 1183 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 1013 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.8 
 
 		 1175 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  32.1 
 
 		 966 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.17 
 
 		 1360 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  32.28 
 
 		 981 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.7 
 
 		 1048 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.22 
 
 		 1006 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.68 
 
 		 1666 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.59 
 
 		 1441 aa  105  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.64 
 
 		 1114 aa  105  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.33 
 
 		 1044 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  28.03 
 
 		 1264 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.73 
 
 		 1093 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.82 
 
 		 1071 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.24 
 
 		 1055 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 1644 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  31.44 
 
 		 956 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 		 1105 aa  99.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  30.06 
 
 		 1145 aa  99  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.78 
 
 		 1055 aa  99  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 1422 aa  98.2  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.1 
 
 		 1131 aa  98.2  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.11 
 
 		 1295 aa  98.2  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  30.53 
 
 		 957 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 		 965 aa  97.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 		 1151 aa  96.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.21 
 
 		 1080 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 982 aa  96.3  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  31.56 
 
 		 963 aa  96.3  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>