129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3653 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  100 
 
 		 319 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  67.28 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  45.45 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  45.45 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  42.81 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  42.38 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  43.46 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  41.56 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  36.34 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  37.46 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  41.79 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  44.49 
 
 		 348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  44.49 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  44.49 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  44.07 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  44.07 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  44.07 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  44.07 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  36.79 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  41.77 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  41.77 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  41.77 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  39.26 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  39.26 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  38.46 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  48.24 
 
 		 208 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  33.62 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  37.93 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  29.82 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  35.23 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  34.91 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  30.86 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  35.05 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  38.38 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  29.49 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  36.81 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  32.78 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  32.63 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  30.57 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  32.04 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  38.1 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  30.21 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  35.26 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  29.49 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  29.49 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  28.81 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  29.06 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  29.72 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  29.12 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  31.22 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  31.22 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  30.04 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  29.61 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  32.12 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  31.46 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  31.6 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  31.6 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  31.6 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  27.75 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  29.96 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  30.3 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  28.71 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  31.18 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  30.83 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  29.36 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  29.79 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  29.13 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.51 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  27.07 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  30.88 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  27.89 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  26.83 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  29.38 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  28.39 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  33.82 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  27.23 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  26.4 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  29.53 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.78 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  22.37 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  25.82 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  28.51 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  34.68 
 
 		 267 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  26.3 
 
 		 261 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 366 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  28.7 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  28.72 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  31.16 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.02 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  26.58 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  28.95 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  32.52 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  30.2 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  32.52 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  32.52 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  32.52 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  32.52 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  32.52 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  29.22 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>