98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0027 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 381 aa  779    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  64.11 
 
 		 372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.25 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  29.18 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  24.36 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  22.95 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.45 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  26.17 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  26.94 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  22.6 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  20.36 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  21.37 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  21.45 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 368 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  22.56 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  27.19 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  23.1 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.76 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  25.13 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  19.85 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  24.35 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  25.17 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  27.85 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  19.18 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  23.81 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25.74 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  23.53 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  31.74 
 
 		 568 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  21.47 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25.47 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  25.34 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 215 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 191 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  30.81 
 
 		 589 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 588 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  21.97 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.22 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 586 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 229 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  37.96 
 
 		 578 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 141 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  27.85 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  20.12 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  26.01 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  41.67 
 
 		 232 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0306  transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0338  transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 		 248 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  41.54 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  35.23 
 
 		 839 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  22.53 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>