More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2264 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  71.75 
 
 		 719 aa  952    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  100 
 
 		 722 aa  1456    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  95.57 
 
 		 722 aa  1364    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  51.06 
 
 		 759 aa  621  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  48.5 
 
 		 637 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  51.21 
 
 		 760 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  48.22 
 
 		 729 aa  582  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  45.91 
 
 		 681 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  45.73 
 
 		 703 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  44.59 
 
 		 713 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  43.83 
 
 		 705 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  45.2 
 
 		 678 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  41.21 
 
 		 703 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  42.63 
 
 		 726 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  41.84 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  41.18 
 
 		 687 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  41.2 
 
 		 687 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  40.8 
 
 		 683 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  41.14 
 
 		 699 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.62 
 
 		 672 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  43.26 
 
 		 593 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  41.3 
 
 		 683 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  41.3 
 
 		 671 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  40.81 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  40.95 
 
 		 671 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  40.95 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  40.81 
 
 		 807 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  40.95 
 
 		 671 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  40 
 
 		 672 aa  465  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  40.95 
 
 		 671 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  40.95 
 
 		 671 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  40.14 
 
 		 671 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  40.41 
 
 		 671 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  39.68 
 
 		 672 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  40.41 
 
 		 671 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  40.14 
 
 		 671 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  39.89 
 
 		 702 aa  459  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  39.63 
 
 		 614 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  40.27 
 
 		 671 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  43.31 
 
 		 590 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  40.41 
 
 		 671 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  39.75 
 
 		 699 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  40 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  42.81 
 
 		 589 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  43.64 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  42.41 
 
 		 594 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  42.62 
 
 		 594 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  40.66 
 
 		 769 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  38.04 
 
 		 573 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2364  Calcium-binding EF-hand-containing protein  39.32 
 
 		 695 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2877  Na+/solute symporter  39.18 
 
 		 695 aa  416  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.81009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  39.7 
 
 		 586 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  41.97 
 
 		 591 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  42.35 
 
 		 559 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  39.61 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  39.41 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  37.65 
 
 		 593 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  38.47 
 
 		 568 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  41.35 
 
 		 619 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  38.15 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  43.07 
 
 		 563 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  41.75 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  39.94 
 
 		 676 aa  399  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  39.94 
 
 		 578 aa  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  38.44 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.72 
 
 		 582 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  38.74 
 
 		 572 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  38.36 
 
 		 589 aa  389  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  38.05 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  39.67 
 
 		 575 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  39.07 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  41.02 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  38.12 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  37.59 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  40.72 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  37.89 
 
 		 589 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  38.22 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  38.43 
 
 		 604 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  37.14 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  38.55 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  38.48 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  37.8 
 
 		 603 aa  364  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  36.92 
 
 		 596 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  38.32 
 
 		 605 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  38.32 
 
 		 605 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  38.14 
 
 		 605 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  37.65 
 
 		 578 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  37.57 
 
 		 578 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  37.72 
 
 		 578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  36.91 
 
 		 578 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  36.91 
 
 		 578 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  37.06 
 
 		 578 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  36.91 
 
 		 578 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.01 
 
 		 560 aa  323  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  36.63 
 
 		 578 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  34.93 
 
 		 618 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  37.94 
 
 		 548 aa  306  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  36.36 
 
 		 622 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  56.11 
 
 		 558 aa  241  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>