More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0087 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0087  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.804652  hitchhiker  0.00443687 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0090  type II and III secretion system protein  88.5 
 
 		 353 aa  358  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  54.1 
 
 		 721 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  54.1 
 
 		 721 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  50.53 
 
 		 710 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  49.74 
 
 		 706 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  50.25 
 
 		 714 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  49.21 
 
 		 710 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  51.32 
 
 		 717 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  52.88 
 
 		 726 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  48.68 
 
 		 721 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  49.47 
 
 		 543 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  48.65 
 
 		 575 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  48.65 
 
 		 616 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  47.64 
 
 		 465 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  48.65 
 
 		 527 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  48.65 
 
 		 462 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  48.65 
 
 		 462 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  48.65 
 
 		 462 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  47.64 
 
 		 576 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  48.15 
 
 		 553 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  48.95 
 
 		 371 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  48.95 
 
 		 543 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  48.15 
 
 		 553 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  47.89 
 
 		 543 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  48.15 
 
 		 523 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  46.03 
 
 		 573 aa  184  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  46.81 
 
 		 591 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  49.43 
 
 		 712 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  46.81 
 
 		 567 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  47.21 
 
 		 696 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  45.79 
 
 		 714 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  47.21 
 
 		 696 aa  181  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  46.91 
 
 		 716 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  49.13 
 
 		 715 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  45.99 
 
 		 712 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  42.71 
 
 		 723 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  44.58 
 
 		 547 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  44.79 
 
 		 668 aa  144  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  42.08 
 
 		 580 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  42.39 
 
 		 727 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  41.21 
 
 		 706 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  38.01 
 
 		 694 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  40.98 
 
 		 711 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  40.31 
 
 		 698 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  40.31 
 
 		 698 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  39.36 
 
 		 784 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.66 
 
 		 685 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  39.36 
 
 		 784 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  38.86 
 
 		 683 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  38.92 
 
 		 683 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.59 
 
 		 684 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  38.92 
 
 		 683 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  41.18 
 
 		 699 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  42.46 
 
 		 689 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  38.59 
 
 		 684 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  38.59 
 
 		 684 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  38.92 
 
 		 683 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  38.89 
 
 		 704 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  38.59 
 
 		 684 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  37.8 
 
 		 372 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  37.36 
 
 		 683 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  40.96 
 
 		 682 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  39.01 
 
 		 683 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  35.45 
 
 		 424 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.02 
 
 		 874 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  37.3 
 
 		 578 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  35.45 
 
 		 424 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  37.31 
 
 		 683 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  37.91 
 
 		 688 aa  128  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  35.57 
 
 		 657 aa  128  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  37.63 
 
 		 682 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  41.3 
 
 		 715 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  38.3 
 
 		 729 aa  125  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  38.82 
 
 		 420 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  37.63 
 
 		 682 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  38.82 
 
 		 420 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  38.79 
 
 		 711 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  38.82 
 
 		 420 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  35.68 
 
 		 393 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  37.17 
 
 		 756 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  37.8 
 
 		 710 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  36.36 
 
 		 718 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  38.79 
 
 		 422 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  32.35 
 
 		 413 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  38.18 
 
 		 692 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.01 
 
 		 718 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  34.83 
 
 		 655 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  38.04 
 
 		 792 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  34.78 
 
 		 433 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  38.75 
 
 		 926 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  32.99 
 
 		 413 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  35.43 
 
 		 987 aa  117  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  38.75 
 
 		 946 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  35.23 
 
 		 642 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  34.65 
 
 		 630 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  34.65 
 
 		 636 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  35.16 
 
 		 426 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  33.5 
 
 		 412 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  35.15 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>