More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0045 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  887    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  56.28 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  38.85 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 506 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 440 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 416 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 467 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.73 
 
 		 475 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  35.23 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.49 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.49 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 426 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 578 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 542 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 456 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 536 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 448 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 457 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  33.62 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.4 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  36.64 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  33.53 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 450 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  42.68 
 
 		 198 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 490 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 447 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 426 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 461 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  29.49 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  29.49 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>