More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1914 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  38.14 
 
 		 1028 aa  693    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 1060 aa  2165    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.8 
 
 		 1078 aa  281  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  24.03 
 
 		 982 aa  198  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1048 aa  121  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3587  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1087 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5750  surface antigen (D15)  22.84 
 
 		 1072 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0248549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0419  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1129 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.42 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  19.63 
 
 		 970 aa  85.1  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  23.33 
 
 		 918 aa  81.3  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  29.51 
 
 		 433 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  29.51 
 
 		 433 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.88 
 
 		 970 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.63 
 
 		 572 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 		 969 aa  80.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  26.85 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  21.95 
 
 		 956 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.44 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  33.33 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.73 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  29.27 
 
 		 1005 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  29.51 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  27.22 
 
 		 437 aa  74.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  28.91 
 
 		 450 aa  74.3  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 432 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  27.78 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  21.48 
 
 		 1021 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.43 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  29.92 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 430 aa  72  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 430 aa  72  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 430 aa  72  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  27.73 
 
 		 446 aa  72  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  24.46 
 
 		 427 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 430 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  27.62 
 
 		 442 aa  71.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 461 aa  71.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  26.74 
 
 		 430 aa  70.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  26.2 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.2 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  29.89 
 
 		 437 aa  70.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.79 
 
 		 435 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  26.2 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 431 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  24.6 
 
 		 428 aa  70.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1012 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  25.67 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  26.12 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  26.12 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  26.59 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  31.84 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  27.32 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  26.78 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  28.65 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  24.6 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  26.78 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  20.77 
 
 		 1078 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  24.73 
 
 		 430 aa  67.8  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.96 
 
 		 446 aa  67.4  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.72 
 
 		 298 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 428 aa  67.4  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 436 aa  67.4  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 442 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.36 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  26.78 
 
 		 423 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 442 aa  67.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  27 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 442 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 442 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  24.46 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  34.91 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 407 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  26.78 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  27.72 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.73 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  28.27 
 
 		 1097 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  28.49 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  27.32 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  27.32 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  23.9 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.6 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  24.7 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  23.83 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  26.87 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>