More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0143 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  100 
 
 		 356 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  66.28 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  63.76 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  66.28 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  66.28 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  61.51 
 
 		 352 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  60.56 
 
 		 354 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  55.42 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  48.98 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  51.59 
 
 		 358 aa  298  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  49.11 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  49.36 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  55.95 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  50.96 
 
 		 349 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  49.54 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  51.6 
 
 		 358 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  50.91 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  50.91 
 
 		 358 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  49.04 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  46.33 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  49.12 
 
 		 344 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  47.4 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  44.58 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  45.57 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  45.75 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  42.03 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  46.96 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  46.57 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  46.79 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  46.76 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  48.54 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  44.07 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  48.95 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.17 
 
 		 380 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  41.25 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.47 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.57 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40.78 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  39.71 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.98 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  43.57 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.14 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 		 375 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  37.88 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  39.64 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.12 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.29 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  39.75 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  39.12 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.8 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.63 
 
 		 344 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.49 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.34 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  38.82 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  37.58 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  39.24 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  36.86 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  36.86 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 		 381 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.16 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.26 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  39.81 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  39.74 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  39.61 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  40 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  38.33 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.85 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.18 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>