More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20773 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  100 
 
 		 484 aa  993    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  70.94 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  70.66 
 
 		 475 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  63.32 
 
 		 481 aa  571  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  75.77 
 
 		 411 aa  531  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  44.24 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  48.21 
 
 		 321 aa  291  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.16 
 
 		 338 aa  276  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.97 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.35 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.74 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.03 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.67 
 
 		 333 aa  246  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.88 
 
 		 328 aa  244  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.72 
 
 		 333 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.72 
 
 		 333 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.17 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  42.95 
 
 		 332 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.99 
 
 		 331 aa  237  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.97 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  41.36 
 
 		 286 aa  219  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  40.65 
 
 		 251 aa  206  7e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  40.68 
 
 		 310 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  38.44 
 
 		 302 aa  204  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.31 
 
 		 295 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  38.7 
 
 		 322 aa  194  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  39.36 
 
 		 282 aa  186  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  38.23 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  38.08 
 
 		 304 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.48 
 
 		 299 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  33.87 
 
 		 314 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  39.06 
 
 		 233 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.26 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  33.56 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  31 
 
 		 309 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  30.98 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  32.45 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  31.64 
 
 		 309 aa  113  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  31.64 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 307 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 		 307 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 		 307 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  30.19 
 
 		 307 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  30.19 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 		 302 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  33.58 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 294 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  34.16 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  28.09 
 
 		 294 aa  100  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  30.3 
 
 		 297 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  29.78 
 
 		 310 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  27.48 
 
 		 297 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  31.18 
 
 		 315 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  31.39 
 
 		 303 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2559  tRNA pseudouridine synthase B  31.44 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0116383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  33.67 
 
 		 299 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  34.85 
 
 		 292 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  34.78 
 
 		 321 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1249  tRNA pseudouridine synthase B  31.44 
 
 		 333 aa  98.2  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  31.69 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  31.69 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  32.08 
 
 		 309 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  31.69 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  30.63 
 
 		 322 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  30.24 
 
 		 295 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  28.86 
 
 		 299 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.01 
 
 		 304 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  29.32 
 
 		 305 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  34.33 
 
 		 306 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  32.73 
 
 		 225 aa  96.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  29.39 
 
 		 301 aa  96.3  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  32.57 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  27.12 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  31.86 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  36.18 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  30.96 
 
 		 314 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 306 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  29.34 
 
 		 305 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  29.34 
 
 		 305 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  27.74 
 
 		 303 aa  94.7  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  27.47 
 
 		 300 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  31.87 
 
 		 318 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 310 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 310 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  29.26 
 
 		 299 aa  94.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3381  tRNA pseudouridine synthase B  31.35 
 
 		 332 aa  94  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.092575  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  32.14 
 
 		 301 aa  94  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 295 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  34.68 
 
 		 314 aa  93.6  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 		 310 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  31.22 
 
 		 294 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  31.21 
 
 		 310 aa  93.6  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09390  tRNA pseudouridine 55 synthase  33.95 
 
 		 334 aa  93.2  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.86572 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  30.46 
 
 		 314 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>