144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3718 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 504 aa  1025    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  39.02 
 
 		 536 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.08 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  40.23 
 
 		 560 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  40.92 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  41.11 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  38.57 
 
 		 572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  38.64 
 
 		 551 aa  306  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  42.74 
 
 		 522 aa  302  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 543 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 1195 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  37.48 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  34.57 
 
 		 746 aa  259  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  36.09 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 		 665 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  35.68 
 
 		 527 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  31.38 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.2 
 
 		 691 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  34.53 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  32.21 
 
 		 518 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  29.08 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.46 
 
 		 1585 aa  194  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  29.58 
 
 		 503 aa  180  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  29.42 
 
 		 550 aa  163  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  32.79 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  33.74 
 
 		 1338 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  26.78 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 		 563 aa  153  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.15 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  34.94 
 
 		 512 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  30.17 
 
 		 1474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  30.86 
 
 		 650 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  30.15 
 
 		 556 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.63 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.39 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  29.48 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  31.33 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.7 
 
 		 577 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.32 
 
 		 537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 636 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.25 
 
 		 547 aa  130  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  28.39 
 
 		 532 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  30.52 
 
 		 496 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.45 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.21 
 
 		 515 aa  127  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.26 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.87 
 
 		 558 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.59 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  34.65 
 
 		 542 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  30.37 
 
 		 497 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  33.22 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  28.47 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  31.53 
 
 		 526 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.92 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  30.55 
 
 		 484 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  28.97 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  33.11 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  31.85 
 
 		 901 aa  108  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  26.49 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 571 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  34.39 
 
 		 586 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.01 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.27 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  25.56 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  27.35 
 
 		 797 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 547 aa  100  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  24.52 
 
 		 553 aa  97.1  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 498 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.65 
 
 		 545 aa  95.1  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  26.09 
 
 		 552 aa  92.8  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  25.6 
 
 		 591 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.58 
 
 		 559 aa  90.5  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  28.34 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.76 
 
 		 495 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.69 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.79 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.92 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  27.48 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.06 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.7 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.28 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  23.99 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  25.72 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  28.88 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.76 
 
 		 341 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>