More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1325 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  72.78 
 
 		 513 aa  773    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  100 
 
 		 512 aa  1046    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  44.3 
 
 		 547 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  50.77 
 
 		 617 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  50 
 
 		 604 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  41.94 
 
 		 610 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  49.1 
 
 		 618 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  49.5 
 
 		 622 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  41.05 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  48.98 
 
 		 620 aa  385  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  41.05 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  41.24 
 
 		 546 aa  385  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  40.22 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  42.25 
 
 		 543 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 557 aa  346  7e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  37.15 
 
 		 557 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 557 aa  336  5e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  36.69 
 
 		 557 aa  330  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  35.22 
 
 		 559 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 547 aa  301  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  35.16 
 
 		 628 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  34.64 
 
 		 545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 749 aa  282  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 609 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  35.7 
 
 		 791 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  38.2 
 
 		 549 aa  276  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.16 
 
 		 682 aa  276  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  38.23 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  40 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  38.52 
 
 		 797 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 640 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  36.67 
 
 		 654 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 549 aa  267  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.77 
 
 		 519 aa  259  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  39.1 
 
 		 671 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  33.68 
 
 		 692 aa  256  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  41.69 
 
 		 991 aa  253  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.76 
 
 		 583 aa  252  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  32.5 
 
 		 722 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  34.54 
 
 		 551 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  36.65 
 
 		 847 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.9 
 
 		 770 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.49 
 
 		 591 aa  240  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  35.02 
 
 		 1255 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 831 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.54 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.11 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  36.32 
 
 		 492 aa  220  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 1319 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.62 
 
 		 577 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 1335 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  40.68 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  30.22 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  34.14 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 412 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 515 aa  169  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 311 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.54 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 450 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 477 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  32.6 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  32.24 
 
 		 513 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  31.86 
 
 		 433 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.1 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  31.73 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  35.25 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  31.73 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 504 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  30.52 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  31.47 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 544 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.9 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 454 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  35.88 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  30.72 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.52 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>