More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1325 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  72.78 
 
 
513 aa  773  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  100 
 
 
512 aa  1046  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  44.3 
 
 
547 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  50.77 
 
 
617 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  50 
 
 
604 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  41.94 
 
 
610 aa  407  1e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  49.1 
 
 
618 aa  399  1e-110  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  49.5 
 
 
622 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  41.05 
 
 
546 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  40.87 
 
 
546 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  48.98 
 
 
620 aa  385  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  41.24 
 
 
546 aa  385  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  41.05 
 
 
546 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  40.22 
 
 
549 aa  378  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  42.25 
 
 
543 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
557 aa  346  7e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  37.15 
 
 
557 aa  337  2e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  36.01 
 
 
557 aa  336  5e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  36.69 
 
 
557 aa  330  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
559 aa  327  2e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
547 aa  301  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  35.16 
 
 
628 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  34.64 
 
 
545 aa  285  2e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  34.97 
 
 
749 aa  282  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
609 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  35.7 
 
 
791 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
549 aa  276  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.16 
 
 
682 aa  276  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  38.23 
 
 
510 aa  275  2e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  40 
 
 
558 aa  273  5e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
797 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  38.99 
 
 
640 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  36.67 
 
 
654 aa  269  9e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  36.01 
 
 
549 aa  267  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
556 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.77 
 
 
519 aa  259  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  39.1 
 
 
671 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
692 aa  256  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  35.83 
 
 
542 aa  255  2e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  41.69 
 
 
991 aa  253  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.76 
 
 
583 aa  252  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  32.5 
 
 
722 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  34.54 
 
 
551 aa  245  1e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  36.65 
 
 
847 aa  245  1e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.9 
 
 
770 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.49 
 
 
591 aa  240  6e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  35.02 
 
 
1255 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
831 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
491 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
489 aa  230  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.11 
 
 
492 aa  222  1e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  36.32 
 
 
492 aa  220  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  34.81 
 
 
1319 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.62 
 
 
577 aa  217  3e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  34.81 
 
 
1335 aa  218  3e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  40.68 
 
 
612 aa  214  3e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  30.22 
 
 
572 aa  209  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  34.14 
 
 
473 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  35.46 
 
 
412 aa  173  7e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
515 aa  169  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
311 aa  166  1e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.89 
 
 
476 aa  165  2e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
444 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.23 
 
 
452 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
553 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  35.51 
 
 
450 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.54 
 
 
477 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  32.6 
 
 
438 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
552 aa  154  3e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.4 
 
 
491 aa  154  3e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
513 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  31.86 
 
 
433 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
463 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  31.73 
 
 
428 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  35.25 
 
 
440 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  31.73 
 
 
428 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.62566e-05  hitchhiker  7.63288e-08 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.1 
 
 
445 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.77 
 
 
478 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.89 
 
 
479 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
482 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  30.52 
 
 
548 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.8 
 
 
473 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
504 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  31.47 
 
 
428 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
544 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
484 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.9 
 
 
521 aa  150  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  37.9 
 
 
454 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.37 
 
 
449 aa  149  1e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
472 aa  149  1e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  30.72 
 
 
483 aa  149  1e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
490 aa  149  1e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
467 aa  149  1e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
467 aa  149  1e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
478 aa  149  1e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.89 
 
 
472 aa  148  2e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  29.78 
 
 
552 aa  148  2e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>