More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8304 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33.84 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  36.44 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.48 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.63 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.8 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  27.85 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.84 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  25.77 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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