More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3212 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 525 aa  1051    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  47.92 
 
 		 532 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  47.55 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  48.18 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  48.31 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  46.97 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  46.02 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  47.65 
 
 		 530 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  47.04 
 
 		 531 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  47.86 
 
 		 533 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  45.79 
 
 		 535 aa  452  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  45.66 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  47.46 
 
 		 533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  45.07 
 
 		 530 aa  445  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  44.19 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  43.95 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  43.88 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  42.91 
 
 		 532 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  43.57 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  43.8 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  43.76 
 
 		 533 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  44.36 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  42.94 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  43.58 
 
 		 533 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  42.64 
 
 		 533 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.77 
 
 		 856 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  46.42 
 
 		 618 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  45.2 
 
 		 526 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  43.06 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.51 
 
 		 856 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  43.06 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  42.54 
 
 		 535 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.61 
 
 		 853 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  43.12 
 
 		 614 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  40.91 
 
 		 554 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  43.24 
 
 		 615 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  39.82 
 
 		 554 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.72 
 
 		 844 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  39.85 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.35 
 
 		 845 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  43.49 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.11 
 
 		 531 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  41.79 
 
 		 599 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.16 
 
 		 844 aa  372  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  41.97 
 
 		 618 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.52 
 
 		 849 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  38.62 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  42.3 
 
 		 625 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.07 
 
 		 839 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.43 
 
 		 848 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  40.77 
 
 		 616 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  39.49 
 
 		 531 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  43.99 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 		 532 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  39.58 
 
 		 615 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  43.62 
 
 		 614 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  41.41 
 
 		 621 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  44.07 
 
 		 621 aa  362  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 632 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  41.06 
 
 		 607 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  42.18 
 
 		 633 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  39.29 
 
 		 556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 		 537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  40.31 
 
 		 534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3111  preprotein translocase subunit SecD  41.23 
 
 		 616 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  42.03 
 
 		 622 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  41.03 
 
 		 632 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  40.8 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  41.41 
 
 		 609 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 		 615 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 		 604 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 		 615 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  41.03 
 
 		 632 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  41.23 
 
 		 616 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  41.23 
 
 		 616 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  41.7 
 
 		 616 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3289  preprotein translocase subunit SecD  39.69 
 
 		 604 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  39.31 
 
 		 604 aa  350  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  40.39 
 
 		 636 aa  349  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  40.35 
 
 		 626 aa  349  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1472  preprotein translocase subunit SecD  40.75 
 
 		 610 aa  349  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  41.6 
 
 		 621 aa  349  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1331  protein-export membrane protein SecD  42.41 
 
 		 625 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0264501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  38.68 
 
 		 615 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  38.68 
 
 		 615 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  38.68 
 
 		 615 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  39.89 
 
 		 620 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2482  preprotein translocase subunit SecD  41.04 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000187651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  38.37 
 
 		 615 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  41.27 
 
 		 616 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2880  preprotein translocase subunit SecD  41.27 
 
 		 616 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000488716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  38.68 
 
 		 615 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  41.27 
 
 		 616 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1384  preprotein translocase subunit SecD  40.85 
 
 		 616 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  hitchhiker  0.000000727457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  38.68 
 
 		 615 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  38.68 
 
 		 615 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.75 
 
 		 844 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>