More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0432 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  37.16 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  34.07 
 
 
273 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  35.09 
 
 
274 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  34.06 
 
 
274 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  36.13 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  35.93 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  35.59 
 
 
282 aa  164  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  36.43 
 
 
272 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  31.99 
 
 
284 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  32.84 
 
 
274 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  31.48 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  33.46 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  33.21 
 
 
273 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  32.85 
 
 
262 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  32.34 
 
 
272 aa  148  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  31.72 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  30.63 
 
 
275 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  30.29 
 
 
295 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  31 
 
 
274 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  31.25 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  31.2 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  29.15 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  31.46 
 
 
271 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  29.78 
 
 
274 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  30.04 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  28.62 
 
 
274 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  29.43 
 
 
275 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  30.74 
 
 
273 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  31.01 
 
 
271 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  30.53 
 
 
278 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.88 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  27.05 
 
 
278 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.52 
 
 
287 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25.9 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  25.36 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.18 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  27.1 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.17 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.37 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  26.57 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  29.41 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  22.47 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.46 
 
 
191 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.35 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.35 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.06 
 
 
190 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.14 
 
 
185 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.82 
 
 
202 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.42 
 
 
176 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.06 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.49 
 
 
187 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.82 
 
 
189 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.6 
 
 
194 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.9 
 
 
184 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.6 
 
 
194 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  26.47 
 
 
172 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.37 
 
 
188 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.53 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  25 
 
 
196 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.54 
 
 
163 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35.29 
 
 
810 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 
574 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.89 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1545  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.75 
 
 
553 aa  53.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  44.07 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.24 
 
 
208 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  23.11 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.14 
 
 
170 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  24.71 
 
 
182 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.12 
 
 
183 aa  52  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  25.29 
 
 
176 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0539  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  38.64 
 
 
568 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.289603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 
75 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.13 
 
 
173 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2722  putative polyferredoxin  39.68 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.82 
 
 
748 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.96 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.76 
 
 
60 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0754  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  34.85 
 
 
557 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  27.03 
 
 
195 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1285  iron-sulfur cluster-binding domain protein, putative ferridoxin  40.91 
 
 
550 aa  49.7  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  23.43 
 
 
188 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0920  iron-sulfur cluster-binding protein  38.1 
 
 
136 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1166  putative iron-sulfur binding protein  35.09 
 
 
707 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421061  normal  0.487764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  32.18 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  19.08 
 
 
192 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  33.93 
 
 
502 aa  49.3  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.14 
 
 
441 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  35.71 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2679  putative polyferredoxin  38.71 
 
 
287 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_791  iron-sulfur cluster-binding protein, ferredoxin-like protein  36.51 
 
 
136 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0262  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.94 
 
 
147 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0832222 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.859312  normal  0.859235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.33 
 
 
179 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2766  putative polyferredoxin  38.71 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2785  putative polyferredoxin  38.71 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2897  putative polyferredoxin  38.71 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.4 
 
 
186 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>