More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3708 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  100 
 
 		 1039 aa  2117    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  43.37 
 
 		 911 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 1105 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 924 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  49.05 
 
 		 1328 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  33.11 
 
 		 1185 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  48.46 
 
 		 1215 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  31.63 
 
 		 1262 aa  426  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  39.97 
 
 		 785 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.61 
 
 		 1424 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  31.56 
 
 		 1050 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  32.89 
 
 		 1128 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  47.97 
 
 		 1507 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.59 
 
 		 771 aa  388  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  47.15 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.12 
 
 		 1186 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 		 1288 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.39 
 
 		 767 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  31.32 
 
 		 1044 aa  373  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.45 
 
 		 787 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  44.52 
 
 		 725 aa  366  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 1125 aa  355  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 843 aa  347  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.76 
 
 		 885 aa  341  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  41.22 
 
 		 1488 aa  339  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 953 aa  340  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1068 aa  340  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.55 
 
 		 568 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  54.55 
 
 		 568 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  41.41 
 
 		 799 aa  332  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.59 
 
 		 991 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30 
 
 		 1131 aa  310  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1088 aa  304  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  47.77 
 
 		 444 aa  302  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1283 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  28.62 
 
 		 822 aa  294  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 814 aa  292  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  49.53 
 
 		 825 aa  290  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.94 
 
 		 1056 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  32.63 
 
 		 977 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1404 aa  277  7e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1550 aa  277  8e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  49.83 
 
 		 919 aa  277  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  30.24 
 
 		 963 aa  273  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 		 1146 aa  272  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  46.2 
 
 		 751 aa  272  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  30.28 
 
 		 672 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  25.91 
 
 		 1324 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.11 
 
 		 2145 aa  263  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  52.8 
 
 		 284 aa  262  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  26.8 
 
 		 845 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  30.13 
 
 		 680 aa  247  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.06 
 
 		 828 aa  246  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  45.67 
 
 		 362 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  51.15 
 
 		 311 aa  245  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  28.79 
 
 		 1136 aa  244  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  27.45 
 
 		 849 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 776 aa  238  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 857 aa  238  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  38.08 
 
 		 443 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  25.7 
 
 		 843 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 		 577 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  27.15 
 
 		 934 aa  228  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  38.38 
 
 		 493 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.46 
 
 		 838 aa  221  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.62 
 
 		 801 aa  221  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 1290 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.1 
 
 		 1228 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  51.36 
 
 		 481 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 966 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1212 aa  208  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.28 
 
 		 1000 aa  206  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  24.55 
 
 		 1314 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  26.19 
 
 		 675 aa  204  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  26.32 
 
 		 859 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  25.52 
 
 		 897 aa  201  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  25.2 
 
 		 1500 aa  201  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  24.24 
 
 		 1309 aa  199  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  28.23 
 
 		 713 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 949 aa  194  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  24.83 
 
 		 899 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 		 669 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.22 
 
 		 732 aa  187  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  46.94 
 
 		 212 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  24.94 
 
 		 992 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  26.76 
 
 		 829 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1383 aa  186  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  25.03 
 
 		 900 aa  184  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.8 
 
 		 667 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 837 aa  180  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  23.95 
 
 		 1509 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  55.7 
 
 		 1094 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  23.79 
 
 		 793 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1010 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 1028 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.22 
 
 		 1040 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  49.16 
 
 		 190 aa  172  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  31.44 
 
 		 919 aa  168  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1523 aa  167  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.6 
 
 		 968 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>