More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0359 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  283  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  41.22 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  38.93 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  25.2 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.7 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  24.17 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  31.31 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  23.66 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  28.81 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  23.53 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  25.66 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  26.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>