More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2148 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  100 
 
 
831 aa  1702  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  70.13 
 
 
1319 aa  1081  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  72.02 
 
 
847 aa  1222  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  70.29 
 
 
1335 aa  1094  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  74.3 
 
 
612 aa  932  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  65.39 
 
 
1255 aa  987  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  42.12 
 
 
797 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  42.33 
 
 
791 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
749 aa  425  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  39.16 
 
 
682 aa  425  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  41.76 
 
 
591 aa  417  1e-115  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
609 aa  416  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
542 aa  412  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  41.87 
 
 
551 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  40.86 
 
 
556 aa  406  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  37.04 
 
 
558 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  38.14 
 
 
549 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  46.1 
 
 
547 aa  379  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
549 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  37.94 
 
 
628 aa  372  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  46.21 
 
 
654 aa  372  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
640 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.96 
 
 
583 aa  337  6e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  45.82 
 
 
692 aa  337  6e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  37.15 
 
 
991 aa  331  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  42 
 
 
770 aa  318  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  36.78 
 
 
545 aa  312  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
722 aa  298  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  35.65 
 
 
510 aa  286  1e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  37.96 
 
 
618 aa  282  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  40.27 
 
 
671 aa  278  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
519 aa  276  1e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  41.76 
 
 
604 aa  275  2e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  43.8 
 
 
622 aa  272  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  40.35 
 
 
610 aa  270  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
546 aa  266  9e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  38.85 
 
 
617 aa  266  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  39.54 
 
 
546 aa  266  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  36.04 
 
 
620 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
546 aa  264  7e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  38.54 
 
 
557 aa  264  7e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  38.23 
 
 
557 aa  259  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
546 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  38.79 
 
 
557 aa  253  9e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  37.63 
 
 
557 aa  253  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  36.22 
 
 
549 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
547 aa  252  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  37.37 
 
 
559 aa  251  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.43 
 
 
543 aa  246  2e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.39 
 
 
492 aa  240  9e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.41 
 
 
491 aa  239  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.39 
 
 
492 aa  237  6e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
512 aa  232  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  35.54 
 
 
577 aa  225  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  34.46 
 
 
513 aa  225  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  35.04 
 
 
572 aa  223  1e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.23 
 
 
489 aa  211  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.55 
 
 
311 aa  197  8e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
548 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
552 aa  193  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  33.16 
 
 
552 aa  188  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.1 
 
 
553 aa  187  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.1 
 
 
553 aa  187  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.1 
 
 
553 aa  187  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.1 
 
 
553 aa  187  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
544 aa  181  6e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.05 
 
 
476 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.84 
 
 
473 aa  161  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
440 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  32.56 
 
 
491 aa  158  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
515 aa  157  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.04 
 
 
452 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.04 
 
 
450 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.2 
 
 
472 aa  152  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
477 aa  151  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
444 aa  151  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.15 
 
 
449 aa  149  2e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
463 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.53 
 
 
408 aa  148  4e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  31.06 
 
 
463 aa  148  4e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.07 
 
 
454 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.22 
 
 
472 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  32.64 
 
 
478 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  32.15 
 
 
487 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.28 
 
 
438 aa  146  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
452 aa  145  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.28 
 
 
460 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  27.99 
 
 
453 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  30.99 
 
 
454 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  29.6 
 
 
467 aa  145  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  28.78 
 
 
457 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  29.18 
 
 
440 aa  144  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  31.23 
 
 
438 aa  143  1e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  32.17 
 
 
468 aa  143  1e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  30.17 
 
 
465 aa  142  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  29.91 
 
 
624 aa  143  2e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  29.48 
 
 
451 aa  143  2e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  29.68 
 
 
463 aa  142  2e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  33 
 
 
634 aa  142  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
412 aa  142  4e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>