More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1496 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  280  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  51.02 
 
 		 288 aa  135  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  51.37 
 
 		 152 aa  133  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  52.48 
 
 		 290 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  43.15 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  52.14 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  51.06 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  49.65 
 
 		 180 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  46.04 
 
 		 207 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  45.27 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  46.94 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  48.23 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  48.3 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  49.66 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  47.55 
 
 		 280 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  48.32 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  47.22 
 
 		 208 aa  117  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  51.01 
 
 		 297 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  47.14 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  46.94 
 
 		 156 aa  115  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  44.51 
 
 		 169 aa  114  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  45 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.31 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  42.45 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  47.55 
 
 		 307 aa  110  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  45.33 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  39.16 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  47.1 
 
 		 283 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  37.86 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  45.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  43.8 
 
 		 281 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  50 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  41.26 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  45.39 
 
 		 305 aa  103  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  43.66 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  48.2 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.42 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.58 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.17 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  43.17 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  41.43 
 
 		 287 aa  98.2  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  43.06 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  40.14 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  43.24 
 
 		 300 aa  96.7  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  43.14 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  45.77 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.25 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  40.85 
 
 		 415 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  36.62 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  50 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  43.8 
 
 		 301 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.11 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34.72 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  37.59 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  36.49 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  38.78 
 
 		 187 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  44.29 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  31.16 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  39.16 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  43.45 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.38 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  42.36 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  40.29 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.67 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  47.41 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  42.66 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  44.9 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  38.89 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  40.97 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  38.1 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  43.44 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  38.19 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  40.41 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  36.51 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  37.5 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  38.19 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  41.13 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  42.67 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 297 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  36.05 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>