More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1483 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  310  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 137 aa  169  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  57.35 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.09 
 
 		 142 aa  84.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 171 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 139 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.62 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.56 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.56 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.68 
 
 		 177 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  36 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  37.25 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.85 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  38.18 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>