More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0059 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0059  diguanylate cyclase  100 
 
 
328 aa  679    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3080  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
620 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1938  diguanylate cyclase  38.61 
 
 
391 aa  99.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2716  diguanylate cyclase/phophodiesterase  40 
 
 
778 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3511  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.37 
 
 
781 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  35.59 
 
 
559 aa  95.9  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2296  GGDEF domain-containing protein  33.94 
 
 
529 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002619  C-di-GMP phosphodiesterase A-related protein  35.58 
 
 
679 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03387  hypothetical protein  35.9 
 
 
679 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2261  diguanylate cyclase  36.63 
 
 
430 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00439148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  37.97 
 
 
806 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1435  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.42 
 
 
896 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.665756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5043  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.89 
 
 
300 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2729  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.2 
 
 
543 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544436  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1004  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.65 
 
 
725 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0215  GAF/GGDEF domain-containing protein  30.24 
 
 
391 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0235  GAF/GGDEF domain-containing protein  30.24 
 
 
391 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3968  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.1 
 
 
887 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.95 
 
 
950 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1312  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.65 
 
 
776 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.61 
 
 
832 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000065  diguanylate cyclase/phosphodiesterase domain 2  32.74 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2019  diguanylate cyclase  31.16 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1813  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.27 
 
 
777 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223015  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0664  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1827  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.22 
 
 
569 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161362  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4014  diguanylate cyclase  33.14 
 
 
605 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3598  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.81 
 
 
877 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1614  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.16 
 
 
771 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0431388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1829  GGDEF domain-containing protein  31.39 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.88 
 
 
707 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2227  diguanylate cyclase  41.03 
 
 
803 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3938  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.14 
 
 
594 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3905  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.49 
 
 
893 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.801054  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3792  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.49 
 
 
893 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0340  diguanylate cyclase  38.89 
 
 
428 aa  90.1  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4412  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.84 
 
 
574 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0317543  normal  0.165306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4493  diguanylate cyclase  37.35 
 
 
404 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.605021  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1900  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.48 
 
 
405 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.56282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  37.11 
 
 
473 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4402  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.69 
 
 
563 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3890  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.36 
 
 
824 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0523  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.71 
 
 
609 aa  89.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.62 
 
 
818 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376785  normal  0.0371729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2600  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.94 
 
 
978 aa  89.4  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.861539  normal  0.836089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3635  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.42 
 
 
656 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4133  diguanylate cyclase  33.14 
 
 
605 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  37.97 
 
 
1076 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4032  diguanylate cyclase  36.69 
 
 
561 aa  89  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0510  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.57 
 
 
765 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  31.53 
 
 
332 aa  89  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5454  RNase II stability modulator  36.2 
 
 
689 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0184  PAS/GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 
684 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  32.12 
 
 
768 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  32.12 
 
 
768 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1539  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.74 
 
 
681 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0594257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5279  RNase II stability modulator  37.13 
 
 
666 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164085  normal  0.0978812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.93 
 
 
700 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133326  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.59 
 
 
884 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.39821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4036  diguanylate cyclase  33.14 
 
 
610 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1152  RNase II stability modulator  36.2 
 
 
667 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.584939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2712  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.26 
 
 
793 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109908 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.66 
 
 
721 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554875  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4101  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.15 
 
 
794 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0595  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.93 
 
 
730 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1231  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.62 
 
 
666 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2268  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.55 
 
 
977 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2066  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.56 
 
 
584 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.684851  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  31.66 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2203  PAS:GGDEF  33.14 
 
 
673 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1496  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.75 
 
 
741 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  27.09 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002693  putative GGDEF family protein  32.53 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1421  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.43 
 
 
724 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2189  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.88 
 
 
729 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.9 
 
 
687 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.25746  normal  0.789676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2185  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.35 
 
 
777 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290622  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  32.12 
 
 
937 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0739  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.65 
 
 
735 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3263  GGDEF domain-containing protein  38.51 
 
 
823 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505272  normal  0.0188665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6880  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.03 
 
 
777 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296113  decreased coverage  0.00757929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1366  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.73 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3985  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.88 
 
 
730 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310873  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1766  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.97 
 
 
688 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.356944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.08 
 
 
769 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0664  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.97 
 
 
688 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0241577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2392  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.97 
 
 
688 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278752  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.72 
 
 
707 aa  86.3  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1106  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  32.97 
 
 
688 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0802  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.97 
 
 
688 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  33.13 
 
 
477 aa  85.9  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  32.95 
 
 
610 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1182  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  32.97 
 
 
688 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  27 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2213  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.61 
 
 
742 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024682 
 
 
-
 
NC_004310  BR0219  sensory box protein  31.43 
 
 
703 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.07 
 
 
875 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00996719  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2075  GGDEF protein  33.54 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3649  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35 
 
 
876 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.02582  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.13 
 
 
833 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0467119  normal  0.0611646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>