More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4207 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  67.12 
 
 		 305 aa  310  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  61.21 
 
 		 305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.55 
 
 		 301 aa  301  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  63.51 
 
 		 303 aa  295  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  59.4 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  62.21 
 
 		 298 aa  284  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  57.89 
 
 		 299 aa  273  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  53.33 
 
 		 308 aa  265  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 308 aa  262  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  55.05 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  54.11 
 
 		 369 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  52.32 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 		 316 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  54.07 
 
 		 311 aa  244  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  52.27 
 
 		 315 aa  244  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  50.44 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  50.44 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  50.85 
 
 		 317 aa  238  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  51.83 
 
 		 315 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  51.83 
 
 		 316 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  50 
 
 		 319 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 322 aa  234  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 336 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  50 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  48.7 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  50 
 
 		 331 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 		 307 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  49.09 
 
 		 331 aa  230  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  50.92 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  51.14 
 
 		 341 aa  228  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  49.77 
 
 		 310 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 		 317 aa  224  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  49.34 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  47.3 
 
 		 329 aa  222  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  49.54 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  49.32 
 
 		 311 aa  222  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  50 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  48.64 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 317 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 314 aa  215  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  48.62 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  43.97 
 
 		 247 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  44.95 
 
 		 328 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  44.14 
 
 		 339 aa  208  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  43.56 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  43.84 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 308 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  44.76 
 
 		 325 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 309 aa  201  6e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  44.49 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  44.39 
 
 		 293 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  41.95 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  41.67 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  42.86 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  43.81 
 
 		 295 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  40.85 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.19 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  41.9 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  42.47 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  39.64 
 
 		 328 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43.64 
 
 		 319 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 318 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.07 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 		 324 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  41.6 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  41.59 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 		 327 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  40.18 
 
 		 338 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  41.12 
 
 		 313 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 356 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  38.81 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.5 
 
 		 257 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 		 305 aa  181  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 		 301 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  43.4 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  41.07 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 		 323 aa  180  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  37.71 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.11 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  41.28 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 		 321 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 309 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>