174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0744 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 436 aa  877    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  36.56 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  34.49 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  34.68 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  32.18 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  32.52 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  32.7 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  33.5 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  32.86 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  34.01 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 477 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  22.03 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  20.42 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  19.76 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  20.57 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  20.57 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  20.57 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  20.57 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  20.57 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  20.4 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  19.71 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  20.57 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  22.37 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  20.6 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  21.41 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  21.32 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 475 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  24.28 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.8 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 506 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.5 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 474 aa  53.9  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 462 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 498 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 462 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 459 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  19.36 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  19.29 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  20.55 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 483 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 542 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 490 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 485 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  44.44 
 
 		 449 aa  49.7  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 542 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  22.9 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  23.83 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  23.83 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>