More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2028 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 191 aa  214  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 191 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  51.1 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  23.79 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  34.31 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  30 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  33.66 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  24.55 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  30.34 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>