More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1877 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 4800 aa  9007    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  45.04 
 
 		 1884 aa  862    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  45.92 
 
 		 2836 aa  632  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 2097 aa  470  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.35 
 
 		 4334 aa  394  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.75 
 
 		 2954 aa  369  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.75 
 
 		 1400 aa  344  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  29.64 
 
 		 1628 aa  344  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.2 
 
 		 1145 aa  335  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.85 
 
 		 2911 aa  322  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.65 
 
 		 833 aa  298  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  42.3 
 
 		 946 aa  290  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.9 
 
 		 1079 aa  285  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.12 
 
 		 1279 aa  277  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.87 
 
 		 1390 aa  273  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.9 
 
 		 3954 aa  273  5.9999999999999995e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  32.82 
 
 		 1072 aa  268  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.34 
 
 		 1544 aa  263  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.72 
 
 		 1582 aa  261  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  34.76 
 
 		 965 aa  255  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.29 
 
 		 1363 aa  245  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.56 
 
 		 1855 aa  239  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.44 
 
 		 1534 aa  238  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  31.38 
 
 		 1213 aa  231  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.22 
 
 		 2467 aa  210  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.96 
 
 		 1795 aa  209  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.41 
 
 		 1499 aa  205  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 1532 aa  205  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  35.86 
 
 		 860 aa  204  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  41.01 
 
 		 595 aa  202  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  33.93 
 
 		 764 aa  198  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.21 
 
 		 1156 aa  197  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  36.28 
 
 		 2689 aa  197  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.08 
 
 		 2678 aa  196  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.63 
 
 		 556 aa  192  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.5 
 
 		 824 aa  191  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  51.64 
 
 		 2105 aa  189  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.14 
 
 		 9867 aa  187  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.64 
 
 		 1424 aa  177  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.64 
 
 		 3427 aa  174  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.54 
 
 		 613 aa  169  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 1286 aa  167  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  43.33 
 
 		 1164 aa  166  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  46.27 
 
 		 833 aa  165  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  42.9 
 
 		 526 aa  164  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.49 
 
 		 1415 aa  162  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  36.41 
 
 		 589 aa  162  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  33.45 
 
 		 1112 aa  162  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  31.52 
 
 		 1814 aa  160  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  51.09 
 
 		 982 aa  159  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  35.54 
 
 		 3619 aa  158  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  33.81 
 
 		 1112 aa  158  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.52 
 
 		 1197 aa  158  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  37.5 
 
 		 745 aa  156  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  38.37 
 
 		 3619 aa  155  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  29.45 
 
 		 1895 aa  154  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 2107 aa  154  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  33.93 
 
 		 795 aa  151  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  41.09 
 
 		 387 aa  149  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.07 
 
 		 1287 aa  149  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  26.85 
 
 		 3209 aa  148  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.01 
 
 		 3598 aa  148  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.19 
 
 		 1480 aa  146  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  31.52 
 
 		 3026 aa  146  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 		 518 aa  145  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  34.36 
 
 		 623 aa  145  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.07 
 
 		 1236 aa  144  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40.06 
 
 		 2145 aa  143  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  36.56 
 
 		 393 aa  143  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  31.44 
 
 		 942 aa  140  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.26 
 
 		 2667 aa  140  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  45.48 
 
 		 4687 aa  136  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.62 
 
 		 2775 aa  135  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.2 
 
 		 3608 aa  135  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  40.06 
 
 		 387 aa  134  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  33.12 
 
 		 1421 aa  134  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  48.83 
 
 		 759 aa  134  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  27.3 
 
 		 4723 aa  134  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  27.33 
 
 		 14829 aa  133  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  34.32 
 
 		 959 aa  133  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  39.89 
 
 		 396 aa  133  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.77 
 
 		 1884 aa  133  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1306 aa  132  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.7 
 
 		 980 aa  131  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  30.99 
 
 		 1383 aa  131  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 		 682 aa  130  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.8 
 
 		 1180 aa  130  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.97 
 
 		 2807 aa  130  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 491 aa  130  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  39.21 
 
 		 648 aa  129  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  40.08 
 
 		 615 aa  128  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 		 363 aa  128  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  31 
 
 		 1864 aa  127  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  40 
 
 		 437 aa  127  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  45.42 
 
 		 850 aa  127  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  44.53 
 
 		 589 aa  127  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.23 
 
 		 855 aa  125  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.28 
 
 		 2245 aa  125  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.8 
 
 		 950 aa  125  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  36.2 
 
 		 769 aa  125  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>