More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5892 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 843 aa  1715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  58.73 
 
 		 812 aa  947    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  57.77 
 
 		 816 aa  938    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  57.71 
 
 		 839 aa  946    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  57.9 
 
 		 813 aa  944    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  40.44 
 
 		 709 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  40.51 
 
 		 849 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  39.15 
 
 		 738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  30.47 
 
 		 755 aa  306  8.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 697 aa  303  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 758 aa  298  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  30.3 
 
 		 732 aa  294  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 732 aa  290  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 746 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  30.2 
 
 		 733 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 726 aa  272  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 726 aa  271  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 751 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 726 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  28.75 
 
 		 723 aa  242  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 704 aa  239  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 817 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 808 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 808 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 717 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 700 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 809 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 745 aa  227  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 701 aa  224  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 745 aa  224  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 745 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  28.46 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 710 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 764 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  27.18 
 
 		 723 aa  217  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 723 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 716 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  27.8 
 
 		 704 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 718 aa  210  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 783 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 725 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 725 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 725 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 723 aa  207  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  26.43 
 
 		 721 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 725 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  27.01 
 
 		 713 aa  205  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 723 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 723 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 817 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 721 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 698 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  26.19 
 
 		 714 aa  191  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  26.21 
 
 		 713 aa  180  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 739 aa  180  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 716 aa  179  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.05 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 753 aa  153  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  31.44 
 
 		 332 aa  128  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 817 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 841 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 841 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.93 
 
 		 833 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 828 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 841 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 828 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.93 
 
 		 862 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.18 
 
 		 862 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.97 
 
 		 861 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  29.23 
 
 		 808 aa  85.9  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 828 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.27 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 806 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 828 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 841 aa  82.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.7 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 828 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 688 aa  82  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 835 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 797 aa  80.1  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  24.44 
 
 		 857 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 797 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 675 aa  79  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 802 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 814 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  28.16 
 
 		 633 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 827 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 828 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 799 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 1020 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 795 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 825 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  42.48 
 
 		 801 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 797 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  42.48 
 
 		 801 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.41 
 
 		 721 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>