133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2108 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 806 aa  1652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  32.35 
 
 		 1050 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.74 
 
 		 1495 aa  300  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  38.39 
 
 		 627 aa  243  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  36.45 
 
 		 2457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  35.96 
 
 		 1041 aa  215  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.76 
 
 		 1059 aa  204  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.76 
 
 		 1059 aa  204  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  27.28 
 
 		 689 aa  201  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  32.41 
 
 		 1037 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  32.43 
 
 		 331 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  34.33 
 
 		 366 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  31.82 
 
 		 338 aa  194  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  30.21 
 
 		 1020 aa  188  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  34.05 
 
 		 323 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 619 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  33.51 
 
 		 1478 aa  183  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.27 
 
 		 321 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.26 
 
 		 1019 aa  181  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  27.85 
 
 		 756 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.59 
 
 		 697 aa  179  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  32.15 
 
 		 359 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  31.61 
 
 		 370 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  26.88 
 
 		 1018 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  32.84 
 
 		 324 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.69 
 
 		 369 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  28.61 
 
 		 423 aa  161  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  29.95 
 
 		 374 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 347 aa  159  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  32.86 
 
 		 347 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.81 
 
 		 407 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 		 333 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.13 
 
 		 382 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  26.96 
 
 		 690 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.23 
 
 		 497 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  28 
 
 		 820 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 		 837 aa  147  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  27.99 
 
 		 337 aa  147  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  32.34 
 
 		 423 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  30.38 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  31.94 
 
 		 371 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  28.79 
 
 		 815 aa  142  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  28.94 
 
 		 474 aa  140  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 1077 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  28.65 
 
 		 457 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  27.97 
 
 		 1001 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  29.39 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  28.65 
 
 		 495 aa  134  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  30.59 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 678 aa  132  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 		 756 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  27.52 
 
 		 490 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  28.38 
 
 		 487 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  30.57 
 
 		 477 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  31.3 
 
 		 451 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.33 
 
 		 474 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  29.74 
 
 		 488 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  28.61 
 
 		 829 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  28.13 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  28.33 
 
 		 451 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  28.45 
 
 		 328 aa  129  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  29.63 
 
 		 503 aa  129  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  27.45 
 
 		 912 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  29.28 
 
 		 376 aa  127  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  27.15 
 
 		 309 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  28.17 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  27.58 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  29 
 
 		 317 aa  126  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.03 
 
 		 1146 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  25.17 
 
 		 1780 aa  124  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  27.69 
 
 		 520 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.09 
 
 		 370 aa  123  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  29.51 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  28.77 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  27.05 
 
 		 1331 aa  119  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  30.61 
 
 		 364 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  31.23 
 
 		 543 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 628 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  27.68 
 
 		 389 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  28.08 
 
 		 457 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  27.27 
 
 		 387 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  29.11 
 
 		 394 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  27.07 
 
 		 375 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  27.16 
 
 		 383 aa  110  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  24.8 
 
 		 1215 aa  107  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  31.29 
 
 		 1247 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  27.96 
 
 		 388 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  28.84 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  25.48 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  26.5 
 
 		 770 aa  100  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  26.18 
 
 		 357 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  25.58 
 
 		 465 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  26.77 
 
 		 401 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  25.66 
 
 		 566 aa  92.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  27.36 
 
 		 1414 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  23.12 
 
 		 1186 aa  88.6  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  23.59 
 
 		 561 aa  88.6  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  24.5 
 
 		 381 aa  87.8  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 325 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  24.15 
 
 		 574 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>