More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1949 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 346 aa  711    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  46.29 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  43.9 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  45 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  45.4 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  36.84 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  33.62 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  38.54 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  37.58 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  37.42 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.62 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37.67 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.18 
 
 		 344 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  36.48 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  38.98 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  38.49 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  37.2 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  37.09 
 
 		 308 aa  169  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  35.65 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  36.68 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  42.08 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  36.67 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  36.13 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  37.25 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.69 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.87 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  42.29 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  37.29 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  35.19 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  38.54 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.95 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  36.66 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  40.35 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.99 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  35.16 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  40.35 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  35.2 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  36.33 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  34.8 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  35.86 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  35.6 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  39.82 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  35.84 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  34.36 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  34.8 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  34.31 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  35.14 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  35.88 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  35.46 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.46 
 
 		 380 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.95 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  34.34 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  35.97 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  34.03 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  34.03 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  35.22 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  38.94 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  38.78 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  33.12 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  33.12 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  34.97 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  33.55 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.74 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  38.1 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  34.36 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  37.65 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  40.35 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 		 578 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  33.89 
 
 		 348 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  42.29 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  36.05 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  37.6 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  35.12 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  33.77 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  33.66 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  32.9 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  34.19 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  38.02 
 
 		 448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  36.73 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  32.7 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  41.35 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  39.01 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  37.93 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  39.21 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  39.58 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  38.5 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  42.16 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  33.87 
 
 		 435 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>