155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08300 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  100 
 
 		 592 aa  1208    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  48.44 
 
 		 750 aa  196  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  48.45 
 
 		 811 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  49.44 
 
 		 753 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  42.11 
 
 		 613 aa  170  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  43.26 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  40.44 
 
 		 651 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  37.66 
 
 		 2495 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  39.47 
 
 		 807 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  40.8 
 
 		 454 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  37.68 
 
 		 430 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  42.35 
 
 		 440 aa  148  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  39.41 
 
 		 550 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  36.45 
 
 		 478 aa  141  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  39.81 
 
 		 330 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  38.22 
 
 		 602 aa  137  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  40.7 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 		 628 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  35.22 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  37.89 
 
 		 324 aa  124  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  37.37 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  35.29 
 
 		 327 aa  114  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  38.07 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  38.79 
 
 		 817 aa  110  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  37.88 
 
 		 1557 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  41.88 
 
 		 1732 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  36.23 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  41.54 
 
 		 302 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  38.02 
 
 		 331 aa  103  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.39 
 
 		 891 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  35.78 
 
 		 320 aa  101  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.38 
 
 		 292 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  37.56 
 
 		 316 aa  98.6  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  35.32 
 
 		 662 aa  98.2  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  32.75 
 
 		 434 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  31.92 
 
 		 266 aa  97.4  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  31.87 
 
 		 573 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  30.04 
 
 		 552 aa  94  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  32.45 
 
 		 574 aa  87.8  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.26 
 
 		 339 aa  87.4  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  29.52 
 
 		 1131 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  29.52 
 
 		 1131 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  28.92 
 
 		 697 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  39.33 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  32.21 
 
 		 2821 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  40.5 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  29 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  33.51 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  46.84 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  29.39 
 
 		 1527 aa  75.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  28.87 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  29.59 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.05 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  29.96 
 
 		 1514 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  32.39 
 
 		 737 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.24 
 
 		 762 aa  68.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  28.43 
 
 		 248 aa  69.7  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0563  glycoside hydrolase family 25  29.13 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0159511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 270 aa  67  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  26.42 
 
 		 1475 aa  66.6  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  27.41 
 
 		 283 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.37 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  31.91 
 
 		 1363 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  26.11 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  24.88 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  27.64 
 
 		 589 aa  60.5  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.87 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.79 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  30.67 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  25 
 
 		 249 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  24.77 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  25.38 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  29.11 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  26.26 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  26.77 
 
 		 282 aa  57  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  27 
 
 		 272 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  31.89 
 
 		 890 aa  56.6  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  27 
 
 		 272 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 272 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 282 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.5 
 
 		 331 aa  55.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 279 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  27 
 
 		 272 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  27 
 
 		 272 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  26.5 
 
 		 272 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  24.26 
 
 		 257 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  26.5 
 
 		 272 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  26.5 
 
 		 272 aa  54.3  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 292 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  27 
 
 		 272 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  25 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>