More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0098 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  100 
 
 		 550 aa  1118    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  54.95 
 
 		 557 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  52.01 
 
 		 550 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  45.07 
 
 		 555 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  44.59 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  43.28 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  41.47 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  42.07 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  35.94 
 
 		 564 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  35.48 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 563 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  33.45 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  36.53 
 
 		 565 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  35.1 
 
 		 585 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  31.23 
 
 		 582 aa  276  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  35.02 
 
 		 538 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  36.65 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 		 567 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  32.82 
 
 		 556 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 575 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  32.63 
 
 		 842 aa  236  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  32.8 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 		 418 aa  226  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 		 552 aa  224  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  35.73 
 
 		 440 aa  223  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  39.25 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 400 aa  217  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  32.05 
 
 		 544 aa  216  8e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37.66 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.58 
 
 		 455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 		 507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  34.53 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.36 
 
 		 443 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  34.46 
 
 		 448 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 458 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  34.46 
 
 		 448 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  36.7 
 
 		 555 aa  212  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  38.22 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 		 379 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 439 aa  211  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.23 
 
 		 476 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  35.07 
 
 		 435 aa  211  4e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  35.24 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  31.54 
 
 		 526 aa  208  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  30.71 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 525 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  35.91 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  39.21 
 
 		 398 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 		 437 aa  206  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.58 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.74 
 
 		 443 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  33 
 
 		 547 aa  204  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 		 446 aa  203  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 		 535 aa  203  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  32.42 
 
 		 560 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  34.8 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  34.73 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 		 444 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  34.48 
 
 		 434 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  32.05 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  35.22 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  33.7 
 
 		 471 aa  202  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  34.65 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  36.14 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 449 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 453 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 445 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  35.29 
 
 		 549 aa  200  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 		 423 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  37.66 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  35.35 
 
 		 439 aa  200  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 		 440 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 		 440 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  33.23 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  33.91 
 
 		 457 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 440 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  34.74 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.17 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  34.68 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  34.76 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>