More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3558 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  25.81 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  26.88 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  26.26 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  24.32 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  27.13 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  26.83 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
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NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  19.85 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 218 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
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NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
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NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 244 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  36.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
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