More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1708 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 888 aa  1794    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.1 
 
 		 915 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.03 
 
 		 874 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.91 
 
 		 855 aa  386  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.83 
 
 		 913 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.47 
 
 		 878 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.99 
 
 		 844 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.13 
 
 		 919 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.52 
 
 		 849 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.6 
 
 		 882 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.08 
 
 		 805 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.05 
 
 		 808 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.81 
 
 		 817 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  34.13 
 
 		 803 aa  330  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.2 
 
 		 871 aa  327  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  30.76 
 
 		 869 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.86 
 
 		 822 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 817 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 		 809 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.56 
 
 		 813 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 880 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.36 
 
 		 808 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.25 
 
 		 823 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 		 846 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  31.86 
 
 		 796 aa  307  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  31.02 
 
 		 802 aa  306  8.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  32.39 
 
 		 811 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.97 
 
 		 879 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.75 
 
 		 887 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.49 
 
 		 804 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.19 
 
 		 887 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.66 
 
 		 817 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.66 
 
 		 883 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.39 
 
 		 807 aa  296  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 		 862 aa  295  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  30.78 
 
 		 821 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.39 
 
 		 816 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.63 
 
 		 807 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 893 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.73 
 
 		 884 aa  290  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  29.22 
 
 		 865 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  28.54 
 
 		 831 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  30.13 
 
 		 814 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  29.02 
 
 		 805 aa  287  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.77 
 
 		 805 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  28.76 
 
 		 797 aa  285  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.49 
 
 		 798 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.99 
 
 		 808 aa  274  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  31.34 
 
 		 800 aa  273  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.76 
 
 		 805 aa  273  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.18 
 
 		 848 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  30.87 
 
 		 810 aa  270  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  30.15 
 
 		 808 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  29.17 
 
 		 809 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.34 
 
 		 805 aa  267  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  30.78 
 
 		 816 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.41 
 
 		 819 aa  262  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.8 
 
 		 844 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  29.3 
 
 		 805 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.05 
 
 		 861 aa  257  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  30.85 
 
 		 809 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  29.39 
 
 		 804 aa  254  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 812 aa  254  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  28.01 
 
 		 803 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  31.29 
 
 		 806 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.55 
 
 		 810 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.66 
 
 		 820 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  26.77 
 
 		 845 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  29.6 
 
 		 808 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.93 
 
 		 828 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.47 
 
 		 821 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  28.62 
 
 		 931 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  29.09 
 
 		 803 aa  234  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  28.33 
 
 		 810 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.37 
 
 		 835 aa  220  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  28.87 
 
 		 819 aa  217  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  27.97 
 
 		 843 aa  215  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 813 aa  213  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 		 809 aa  179  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.68 
 
 		 810 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 810 aa  159  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  22.99 
 
 		 807 aa  150  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 		 793 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 		 800 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 789 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 770 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 809 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 798 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 		 791 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 795 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 794 aa  131  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 		 804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 795 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24 
 
 		 802 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 802 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 816 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 792 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  24 
 
 		 809 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 791 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 790 aa  121  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>