299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0040 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
211 aa  420  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  40.76 
 
 
219 aa  126  2e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 
223 aa  79.7  3e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
235 aa  75.9  4e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
250 aa  73.2  2e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
229 aa  72.4  5e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
228 aa  70.1  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
259 aa  70.5  2e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
221 aa  70.1  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
218 aa  69.7  3e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
253 aa  68.6  8e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 
268 aa  68.2  9e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
237 aa  67  2e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
263 aa  67  2e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  33.05 
 
 
239 aa  66.2  3e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 
246 aa  66.6  3e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.73 
 
 
222 aa  66.2  4e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
272 aa  65.9  5e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
183 aa  65.5  5e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
268 aa  63.9  1e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 
249 aa  63.9  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
242 aa  63.5  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
259 aa  62.8  3e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  29.87 
 
 
213 aa  63.2  3e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
285 aa  62.8  4e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
204 aa  62.8  4e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
239 aa  62.4  5e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 
234 aa  62  6e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 
225 aa  62  7e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
224 aa  60.8  1e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 
240 aa  61.2  1e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
242 aa  61.2  1e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  29.79 
 
 
199 aa  61.2  1e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  26.1 
 
 
255 aa  60.1  2e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
268 aa  60.5  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 
218 aa  60.1  2e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 
236 aa  60.1  2e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
216 aa  60.5  2e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
245 aa  60.5  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
211 aa  59.7  3e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 
214 aa  59.7  3e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
249 aa  59.3  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
272 aa  58.9  5e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.57 
 
 
260 aa  58.9  6e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
223 aa  58.5  7e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
343 aa  58.2  8e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 
230 aa  58.5  8e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  28.36 
 
 
223 aa  57.4  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 
258 aa  57.8  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
267 aa  57.8  1e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  25.5 
 
 
261 aa  57  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 
311 aa  57.4  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 
263 aa  57  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 
224 aa  56.6  3e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
250 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
250 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
250 aa  56.2  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 
343 aa  55.8  4e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 
222 aa  56.2  4e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  6.04778e-08 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  31.08 
 
 
228 aa  55.5  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
250 aa  55.1  7e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
218 aa  55.1  7e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  29.08 
 
 
203 aa  55.1  8e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  24.07 
 
 
272 aa  54.7  9e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 
262 aa  54.3  1e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
210 aa  54.7  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
315 aa  54.3  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 
218 aa  54.7  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  24.89 
 
 
250 aa  54.7  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  31.4 
 
 
241 aa  54.3  1e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.17 
 
 
247 aa  53.5  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
278 aa  53.9  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  30.23 
 
 
229 aa  53.9  2e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 
196 aa  53.1  3e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
192 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
203 aa  53.1  3e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 
220 aa  53.1  3e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
192 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
192 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
255 aa  52.8  4e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
226 aa  52.4  4e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
230 aa  52.8  4e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  35.29 
 
 
235 aa  52.8  4e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
230 aa  52.8  4e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 
218 aa  52.4  5e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  5.21041e-06  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
250 aa  52.4  5e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 
259 aa  52.4  5e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
221 aa  52.4  6e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
253 aa  52.4  6e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
211 aa  52  7e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 
241 aa  52  7e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 
234 aa  52  7e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 
315 aa  51.6  8e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
244 aa  51.6  9e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
190 aa  51.6  9e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
212 aa  51.6  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
233 aa  51.6  9e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
225 aa  51.6  9e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>