165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1212 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  781    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  62.15 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  57.83 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  57.67 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  43.11 
 
 		 1450 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  42.51 
 
 		 688 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 484 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 		 601 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 1827 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 608 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  40.92 
 
 		 740 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  39.69 
 
 		 1005 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.09 
 
 		 703 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  39.2 
 
 		 653 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  39.2 
 
 		 653 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 		 747 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  37.46 
 
 		 780 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 		 615 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 747 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.43 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 1038 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 520 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.94 
 
 		 760 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.94 
 
 		 1034 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  40.92 
 
 		 577 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.76 
 
 		 1764 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 574 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40.13 
 
 		 578 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 767 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 3145 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 607 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  33.93 
 
 		 1077 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.78 
 
 		 872 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 529 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.19 
 
 		 604 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  33.81 
 
 		 615 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 1212 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 		 523 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  37.62 
 
 		 648 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 542 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.9 
 
 		 620 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 612 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 556 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.91 
 
 		 1677 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 620 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.39 
 
 		 637 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 635 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 635 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 646 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 611 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 636 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 		 527 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  33.23 
 
 		 525 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 689 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 649 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 649 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 611 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 593 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 571 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  34.64 
 
 		 540 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.3 
 
 		 626 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.05 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 955 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  35.09 
 
 		 503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.65 
 
 		 546 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 559 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.92 
 
 		 614 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.92 
 
 		 614 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 614 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 614 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.92 
 
 		 626 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.92 
 
 		 626 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 496 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 636 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  32.94 
 
 		 600 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 545 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 		 545 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 545 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  33.23 
 
 		 630 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 592 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.05 
 
 		 714 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 438 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 588 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 662 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 637 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>