More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2107 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 599 aa  686    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  62.27 
 
 		 594 aa  696    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  77.15 
 
 		 582 aa  879    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  68.51 
 
 		 586 aa  778    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 597 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  71.18 
 
 		 582 aa  824    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  100 
 
 		 580 aa  1172    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 586 aa  733    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 		 582 aa  763    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  60.03 
 
 		 608 aa  662    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  66.55 
 
 		 581 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 594 aa  665    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 588 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 585 aa  739    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 584 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 		 586 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 585 aa  748    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  82.9 
 
 		 580 aa  1003    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  65.85 
 
 		 582 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  63.34 
 
 		 591 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 576 aa  760    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 584 aa  756    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  70.5 
 
 		 582 aa  813    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 584 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 603 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 596 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  66.84 
 
 		 583 aa  758    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 589 aa  726    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 607 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 584 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 585 aa  746    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  54.59 
 
 		 610 aa  622  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 604 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 570 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  42.93 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 574 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 573 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 575 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 571 aa  429  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 575 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 576 aa  425  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 579 aa  422  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 577 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 574 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 587 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 584 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 573 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 572 aa  419  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 584 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 569 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 565 aa  415  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 573 aa  415  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 564 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 585 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 571 aa  412  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 568 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>