More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0680 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 574 aa  709    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 571 aa  1177    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 585 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 567 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 567 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 569 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 573 aa  618  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 570 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 566 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 566 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 573 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 566 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 566 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 576 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 568 aa  614  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 566 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 566 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 566 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 574 aa  599  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 572 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 577 aa  599  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 577 aa  598  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 572 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 571 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  51.4 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 572 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 572 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 576 aa  596  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 571 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 582 aa  592  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 571 aa  594  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 572 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 572 aa  591  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 572 aa  591  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 572 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 572 aa  588  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 571 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 572 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 572 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 571 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 571 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 570 aa  588  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 571 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 572 aa  588  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 576 aa  586  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 570 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 571 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 574 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  50.79 
 
 		 575 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 571 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 564 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 564 aa  578  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 571 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 569 aa  581  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 569 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 571 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 584 aa  579  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 571 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 569 aa  579  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 572 aa  579  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 580 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 574 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>