More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12860 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  74.61 
 
 		 585 aa  870    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  63.99 
 
 		 591 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 		 597 aa  687    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 594 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 		 599 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  64.51 
 
 		 582 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  72.61 
 
 		 581 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  66.9 
 
 		 585 aa  748    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 		 582 aa  782    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  83.33 
 
 		 588 aa  972    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 584 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 582 aa  1166    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 594 aa  664    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  75.09 
 
 		 576 aa  875    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  66.02 
 
 		 580 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 		 580 aa  745    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 582 aa  770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 607 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 		 586 aa  691    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  83.05 
 
 		 584 aa  978    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  63.61 
 
 		 586 aa  724    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 608 aa  643    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 582 aa  715    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  71.2 
 
 		 586 aa  816    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  83.05 
 
 		 584 aa  978    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 603 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 		 596 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 583 aa  725    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 589 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  83.05 
 
 		 584 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  82.94 
 
 		 585 aa  974    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  56.11 
 
 		 610 aa  624  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 604 aa  615  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 572 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 572 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 569 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 572 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 579 aa  432  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 587 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 571 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 569 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 567 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 570 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 567 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 569 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 564 aa  425  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 578 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 574 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 575 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 571 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 565 aa  416  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 571 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  40.59 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 566 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 566 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 576 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 576 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 576 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 566 aa  415  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>