More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1707 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 594 aa  676    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 584 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  62.31 
 
 		 591 aa  667    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 607 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 		 596 aa  691    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  63.37 
 
 		 580 aa  734    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  70.36 
 
 		 582 aa  823    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  61.2 
 
 		 599 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  74.61 
 
 		 582 aa  848    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 582 aa  725    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 585 aa  1177    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 597 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 585 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  70.7 
 
 		 582 aa  816    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  64.01 
 
 		 586 aa  744    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 608 aa  666    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 		 581 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  65.76 
 
 		 580 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  75.9 
 
 		 584 aa  895    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 582 aa  743    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  73.76 
 
 		 586 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  77.62 
 
 		 576 aa  915    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  76.33 
 
 		 588 aa  881    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  75.9 
 
 		 584 aa  895    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 603 aa  686    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 594 aa  660    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 		 586 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 583 aa  733    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  64.53 
 
 		 589 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  75.9 
 
 		 584 aa  895    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  75.77 
 
 		 585 aa  881    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  54.65 
 
 		 610 aa  633  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 604 aa  625  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 572 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 571 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 567 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 571 aa  432  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 573 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 570 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 600 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 578 aa  429  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 569 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 570 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 578 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 598 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 574 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 580 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 573 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 573 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 598 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 572 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 573 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>